O serviço de sequenciamento NGS(Next-Generation Sequencing) da Zymo Research torna possível avaliar regiões variáveis dos genes 16S, ITS e 18S com fidelidade de dados e atenção especial para a eliminação de vieses desde a coleta até o sequenciamento das amostras.
Realizado com o mesmo padrão do laboratório da Zymo Research na California, fornecemos uma qualidade superior aos pares nacionais. Suas amostras serão processadas com equipamentos de ponta, rigorosos controles de qualidade, alta rastreabilidade e você receberá um relatório de bioinformática com informações exclusivas que só nosso relatório disponibiliza no mercado.
Você também contará com um suporte técnico dedicado altamente qualificado e de rápida resposta do começo ao fim do processo.
Com uma estrutura brasileira inspirada nos mais modernos laboratórios de sequenciamento do mundo, suas amostras serão processadas no equipamento Illumina NextSeq® e seus resultados estarão assegurados pelos estritos padrões de qualidade baseados no laboratório da Zymo Research da California. Caso você opte por ter resultados prontos para a publicação e livre de vieses, saiba que nosso laboratório é a melhor escolha.
*Illumina® é uma marca registrada do grupo Illumina, Inc.
O workflow de trabalho em microbioma pode incluir vieses em cada etapa, desde a coleta até a análise de dados.
Esses vieses podem distorcer as abundancias absolutas de cada organismos. Por esse motivo a reprodutibilidade de dados na área ainda é um desafio para os cientistas.
Os serviços realizados na Zymo Research incluem controles para a avaliação de vieses, os quais tem sido solicitados pelos revisores das melhores revistas.
Pipelines de sequenciamento de outros prestadores de serviço não avaliam os vieses e podem gerar resultados distorcidos. Saiba mais sobre isso no nosso blog
Apenas a abundância relativa pode não definir as mudanças em uma comunidade microbiana. Em casos como a comparação de tratamentos ou efeitos terapêuticos, pode ser igualmente importante saber como o número de células está mudando.
Veja a comparação de dois grupos distintos que contém diferenças significativas no número de cópias de DNA 16S contidos em cada grupo.
Zymo Research | Laboratório A | Laboratório B | |
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Abundancia Relativa de Microorganismos | |||
Classificação Taxonomica | |||
Quantificação de Abundancia Absoluta de microrganismos | |||
Controles de extração inclusos | |||
Controles de sequenciamento e pipeline de bioinformática inclusos | |||
Banco de Dados apurado por nossos especialistas: livre de erros, anotações inconsistentes e dados de baixa qualidade. | |||
Comprimento de leitura de 2 x 300 bp para cobertura completa da região a ser sequenciada. | |||
Utilização de UDIs para prevenir index hopping | |||
Analise de dados completa e relatório interativo, com heatmaps, comparação de grupos, alpha e beta boxplot. | |||
Sequenciamento 16S V3-V4 com ampla cobertura de Bacteria | |||
Sequenciamento 16S V3-V4 com ampla cobertura de Archeaea | |||
Pipeline completo livre de vieses, da coleta a análise de dados |
Zymo Research | Lab A | Lab B | |
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Abundancia Relativa de Microorganismos | |||
Classificação Taxonomica | |||
Quantificação de Abundancia Absoluta de microrganismos | |||
Controles de extração inclusos | |||
Controles de sequenciamento e pipeline de bioinformática inclusos | |||
Banco de Dados apurado por nossos especialistas: livre de erros, anotações inconsistentes e dados de baixa qualidade. | |||
Comprimento de leitura de 2 x 300 bp para cobertura completa da região a ser sequenciada. | |||
Utilização de UDIs para prevenir index hopping | |||
Analise de dados completa e relatório interativo, com heatmaps, comparação de grupos, alpha e beta boxplot. | |||
Sequenciamento 16S V3-V4 com ampla cobertura de Bacteria | |||
Sequenciamento 16S V3-V4 com ampla cobertura de Archeaea | |||
Pipeline completo livre de vieses, da coleta a análise de dados |
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